Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA1P15976 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA1P15976 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA1P15976 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA1P15976 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA1P15976 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA1P15976 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA1P15976 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA1P15976 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA1P15976 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA1P15976 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA1P15976 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA1P15976 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA1P15976 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA1P15976 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA1P15976 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA1P15976 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA1P15976 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA1P15976 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA1P15976 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA1P15976 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATA1P15976 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATA1P15976 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATA1P15976 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATA1P15976 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATA1P15976 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATA1P15976 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GATA1P15976 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATA1P15976 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATA1P15976 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATA1P15976 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATA1P15976 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATA1P15976 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATA1P15976 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATA1P15976 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATA1P15976 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GATA1P15976 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GATA1P15976 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GATA1P15976 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GATA1P15976 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GATA1P15976 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GATA1P15976 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GATA1P15976 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GATA1P15976 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GATA1P15976 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GATA1P15976 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GATA1P15976 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GATA1P15976 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GATA1P15976 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GATA1P15976 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GATA1P15976 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GATA1P15976 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GATA1P15976 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GATA1P15976 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GATA1P15976 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GATA1P15976 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GATA1P15976 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GATA1P15976 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GATA1P15976 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GATA1P15976 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GATA1P15976 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GATA1P15976 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GATA1P15976 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GATA1P15976 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GATA1P15976 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GATA1P15976 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
GATA1P15976 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms