Protein–RNA interactions for Protein: P15313

ATP6V1B1, V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B1P15313 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1B1P15313 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1B1P15313 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B1P15313 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms