Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCG2P13521 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCG2P13521 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCG2P13521 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCG2P13521 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SCG2P13521 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCG2P13521 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCG2P13521 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCG2P13521 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCG2P13521 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCG2P13521 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCG2P13521 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCG2P13521 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCG2P13521 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCG2P13521 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCG2P13521 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCG2P13521 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCG2P13521 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCG2P13521 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCG2P13521 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCG2P13521 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCG2P13521 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCG2P13521 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCG2P13521 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCG2P13521 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCG2P13521 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCG2P13521 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCG2P13521 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCG2P13521 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCG2P13521 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCG2P13521 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SCG2P13521 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCG2P13521 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCG2P13521 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCG2P13521 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCG2P13521 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCG2P13521 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCG2P13521 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCG2P13521 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCG2P13521 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SCG2P13521 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCG2P13521 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCG2P13521 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCG2P13521 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCG2P13521 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCG2P13521 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCG2P13521 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCG2P13521 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCG2P13521 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCG2P13521 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCG2P13521 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SCG2P13521 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCG2P13521 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCG2P13521 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCG2P13521 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCG2P13521 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCG2P13521 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCG2P13521 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCG2P13521 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCG2P13521 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCG2P13521 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCG2P13521 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCG2P13521 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SCG2P13521 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCG2P13521 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCG2P13521 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCG2P13521 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCG2P13521 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SCG2P13521 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCG2P13521 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCG2P13521 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCG2P13521 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCG2P13521 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCG2P13521 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCG2P13521 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCG2P13521 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCG2P13521 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCG2P13521 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCG2P13521 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCG2P13521 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCG2P13521 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCG2P13521 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCG2P13521 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCG2P13521 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCG2P13521 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCG2P13521 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCG2P13521 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCG2P13521 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCG2P13521 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCG2P13521 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCG2P13521 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SCG2P13521 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCG2P13521 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCG2P13521 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCG2P13521 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCG2P13521 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCG2P13521 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SCG2P13521 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCG2P13521 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SCG2P13521 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.8 ms