Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ODC1P11926 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ODC1P11926 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ODC1P11926 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ODC1P11926 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ODC1P11926 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ODC1P11926 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ODC1P11926 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ODC1P11926 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ODC1P11926 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODC1P11926 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODC1P11926 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODC1P11926 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODC1P11926 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODC1P11926 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODC1P11926 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODC1P11926 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ODC1P11926 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ODC1P11926 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ODC1P11926 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ODC1P11926 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ODC1P11926 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ODC1P11926 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ODC1P11926 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ODC1P11926 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ODC1P11926 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ODC1P11926 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ODC1P11926 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ODC1P11926 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ODC1P11926 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ODC1P11926 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ODC1P11926 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ODC1P11926 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ODC1P11926 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ODC1P11926 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ODC1P11926 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ODC1P11926 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ODC1P11926 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ODC1P11926 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ODC1P11926 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ODC1P11926 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ODC1P11926 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ODC1P11926 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ODC1P11926 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ODC1P11926 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ODC1P11926 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ODC1P11926 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ODC1P11926 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ODC1P11926 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ODC1P11926 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ODC1P11926 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ODC1P11926 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ODC1P11926 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ODC1P11926 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ODC1P11926 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ODC1P11926 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODC1P11926 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODC1P11926 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODC1P11926 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODC1P11926 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODC1P11926 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODC1P11926 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODC1P11926 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ODC1P11926 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ODC1P11926 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ODC1P11926 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ODC1P11926 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ODC1P11926 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ODC1P11926 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ODC1P11926 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ODC1P11926 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ODC1P11926 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ODC1P11926 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ODC1P11926 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ODC1P11926 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ODC1P11926 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ODC1P11926 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ODC1P11926 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ODC1P11926 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ODC1P11926 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODC1P11926 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODC1P11926 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODC1P11926 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODC1P11926 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODC1P11926 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODC1P11926 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ODC1P11926 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ODC1P11926 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ODC1P11926 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ODC1P11926 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ODC1P11926 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ODC1P11926 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ODC1P11926 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ODC1P11926 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ODC1P11926 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ODC1P11926 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ODC1P11926 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ODC1P11926 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ODC1P11926 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ODC1P11926 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 865.1 ms