Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARBP10826 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARBP10826 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RARBP10826 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARBP10826 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARBP10826 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARBP10826 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARBP10826 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARBP10826 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARBP10826 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARBP10826 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARBP10826 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARBP10826 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARBP10826 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARBP10826 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARBP10826 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARBP10826 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RARBP10826 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RARBP10826 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARBP10826 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARBP10826 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RARBP10826 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RARBP10826 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARBP10826 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RARBP10826 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARBP10826 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RARBP10826 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RARBP10826 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RARBP10826 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RARBP10826 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RARBP10826 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RARBP10826 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RARBP10826 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RARBP10826 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RARBP10826 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARBP10826 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RARBP10826 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARBP10826 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARBP10826 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARBP10826 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RARBP10826 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RARBP10826 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RARBP10826 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RARBP10826 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARBP10826 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RARBP10826 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARBP10826 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARBP10826 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RARBP10826 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARBP10826 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARBP10826 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARBP10826 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RARBP10826 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARBP10826 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RARBP10826 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARBP10826 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARBP10826 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARBP10826 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARBP10826 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARBP10826 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARBP10826 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARBP10826 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARBP10826 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARBP10826 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARBP10826 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARBP10826 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARBP10826 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARBP10826 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARBP10826 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARBP10826 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARBP10826 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARBP10826 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARBP10826 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARBP10826 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARBP10826 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RARBP10826 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RARBP10826 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RARBP10826 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARBP10826 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARBP10826 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARBP10826 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARBP10826 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARBP10826 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARBP10826 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARBP10826 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARBP10826 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARBP10826 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARBP10826 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARBP10826 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARBP10826 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARBP10826 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARBP10826 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARBP10826 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARBP10826 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARBP10826 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARBP10826 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARBP10826 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARBP10826 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARBP10826 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARBP10826 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms