Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SAA2P0DJI9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAA2P0DJI9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SAA2P0DJI9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAA2P0DJI9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAA2P0DJI9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAA2P0DJI9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAA2P0DJI9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAA2P0DJI9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SAA2P0DJI9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAA2P0DJI9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAA2P0DJI9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAA2P0DJI9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms