Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF888P0CJ79 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF888P0CJ79 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms