Protein–RNA interactions for Protein: P0C881

RSPH10B, Radial spoke head 10 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH10BP0C881 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH10BP0C881 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH10BP0C881 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH10BP0C881 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH10BP0C881 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH10BP0C881 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH10BP0C881 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH10BP0C881 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH10BP0C881 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH10BP0C881 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH10BP0C881 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH10BP0C881 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RSPH10BP0C881 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RSPH10BP0C881 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH10BP0C881 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RSPH10BP0C881 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RSPH10BP0C881 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RSPH10BP0C881 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RSPH10BP0C881 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 479.9 ms