Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKHD1P08F94 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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