Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPP08247 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYPP08247 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYPP08247 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYPP08247 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYPP08247 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYPP08247 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYPP08247 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYPP08247 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYPP08247 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYPP08247 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYPP08247 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYPP08247 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYPP08247 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYPP08247 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYPP08247 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYPP08247 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYPP08247 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYPP08247 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYPP08247 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYPP08247 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYPP08247 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYPP08247 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYPP08247 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYPP08247 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYPP08247 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYPP08247 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYPP08247 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYPP08247 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYPP08247 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYPP08247 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYPP08247 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYPP08247 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYPP08247 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYPP08247 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYPP08247 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYPP08247 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYPP08247 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYPP08247 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYPP08247 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYPP08247 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYPP08247 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYPP08247 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYPP08247 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYPP08247 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYPP08247 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYPP08247 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYPP08247 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYPP08247 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYPP08247 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYPP08247 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYPP08247 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYPP08247 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYPP08247 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYPP08247 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYPP08247 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYPP08247 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYPP08247 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYPP08247 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYPP08247 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYPP08247 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYPP08247 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYPP08247 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYPP08247 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYPP08247 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYPP08247 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYPP08247 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYPP08247 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYPP08247 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYPP08247 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYPP08247 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYPP08247 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYPP08247 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYPP08247 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYPP08247 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYPP08247 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYPP08247 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYPP08247 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYPP08247 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYPP08247 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYPP08247 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYPP08247 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYPP08247 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYPP08247 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYPP08247 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYPP08247 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYPP08247 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYPP08247 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYPP08247 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYPP08247 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYPP08247 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYPP08247 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYPP08247 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYPP08247 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYPP08247 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYPP08247 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYPP08247 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYPP08247 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYPP08247 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYPP08247 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms