Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPSP04118 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPSP04118 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPSP04118 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPSP04118 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPSP04118 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPSP04118 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPSP04118 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPSP04118 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPSP04118 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPSP04118 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPSP04118 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPSP04118 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPSP04118 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPSP04118 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPSP04118 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPSP04118 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPSP04118 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPSP04118 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPSP04118 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPSP04118 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPSP04118 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPSP04118 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLPSP04118 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPSP04118 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPSP04118 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPSP04118 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPSP04118 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPSP04118 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPSP04118 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPSP04118 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPSP04118 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPSP04118 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPSP04118 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPSP04118 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPSP04118 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPSP04118 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPSP04118 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPSP04118 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPSP04118 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPSP04118 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPSP04118 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPSP04118 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPSP04118 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPSP04118 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPSP04118 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPSP04118 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPSP04118 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPSP04118 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPSP04118 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPSP04118 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPSP04118 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPSP04118 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPSP04118 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPSP04118 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPSP04118 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPSP04118 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPSP04118 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPSP04118 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPSP04118 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPSP04118 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPSP04118 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPSP04118 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPSP04118 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLPSP04118 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLPSP04118 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPSP04118 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPSP04118 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPSP04118 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPSP04118 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPSP04118 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPSP04118 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPSP04118 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPSP04118 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPSP04118 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPSP04118 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPSP04118 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPSP04118 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPSP04118 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPSP04118 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPSP04118 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPSP04118 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPSP04118 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPSP04118 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPSP04118 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPSP04118 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPSP04118 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPSP04118 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPSP04118 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPSP04118 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPSP04118 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPSP04118 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPSP04118 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPSP04118 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPSP04118 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPSP04118 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPSP04118 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPSP04118 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLPSP04118 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPSP04118 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms