Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SEC24BO95487 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEC24BO95487 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms