Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNAPINO95295 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNAPINO95295 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNAPINO95295 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNAPINO95295 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNAPINO95295 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNAPINO95295 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNAPINO95295 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNAPINO95295 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNAPINO95295 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAPINO95295 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms