Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRATO95237 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRATO95237 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRATO95237 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRATO95237 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRATO95237 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRATO95237 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRATO95237 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRATO95237 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRATO95237 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRATO95237 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRATO95237 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRATO95237 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRATO95237 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRATO95237 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRATO95237 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRATO95237 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRATO95237 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRATO95237 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRATO95237 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRATO95237 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRATO95237 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRATO95237 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRATO95237 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRATO95237 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRATO95237 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRATO95237 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRATO95237 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRATO95237 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRATO95237 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRATO95237 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRATO95237 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRATO95237 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRATO95237 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRATO95237 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRATO95237 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRATO95237 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRATO95237 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRATO95237 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRATO95237 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRATO95237 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRATO95237 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRATO95237 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRATO95237 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRATO95237 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRATO95237 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRATO95237 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRATO95237 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRATO95237 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRATO95237 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRATO95237 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRATO95237 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRATO95237 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRATO95237 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRATO95237 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRATO95237 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRATO95237 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRATO95237 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRATO95237 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRATO95237 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRATO95237 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRATO95237 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRATO95237 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRATO95237 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRATO95237 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRATO95237 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRATO95237 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRATO95237 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRATO95237 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRATO95237 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRATO95237 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRATO95237 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRATO95237 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRATO95237 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRATO95237 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRATO95237 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRATO95237 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRATO95237 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRATO95237 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRATO95237 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRATO95237 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRATO95237 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRATO95237 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRATO95237 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRATO95237 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRATO95237 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRATO95237 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRATO95237 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRATO95237 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRATO95237 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRATO95237 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRATO95237 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRATO95237 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRATO95237 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRATO95237 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRATO95237 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRATO95237 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRATO95237 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRATO95237 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRATO95237 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms