Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIOO75962 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIOO75962 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIOO75962 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIOO75962 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIOO75962 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIOO75962 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIOO75962 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIOO75962 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIOO75962 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIOO75962 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIOO75962 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIOO75962 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIOO75962 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIOO75962 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIOO75962 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIOO75962 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIOO75962 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIOO75962 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIOO75962 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIOO75962 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIOO75962 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIOO75962 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOO75962 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOO75962 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOO75962 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOO75962 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOO75962 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOO75962 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOO75962 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOO75962 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOO75962 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOO75962 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOO75962 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOO75962 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOO75962 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOO75962 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOO75962 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOO75962 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOO75962 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOO75962 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOO75962 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOO75962 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIOO75962 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIOO75962 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIOO75962 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIOO75962 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIOO75962 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIOO75962 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIOO75962 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIOO75962 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIOO75962 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOO75962 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOO75962 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOO75962 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOO75962 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOO75962 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOO75962 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOO75962 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOO75962 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOO75962 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOO75962 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOO75962 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIOO75962 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIOO75962 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIOO75962 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIOO75962 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIOO75962 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIOO75962 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIOO75962 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIOO75962 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIOO75962 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIOO75962 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIOO75962 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIOO75962 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIOO75962 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIOO75962 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIOO75962 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIOO75962 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIOO75962 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIOO75962 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIOO75962 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOO75962 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOO75962 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOO75962 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOO75962 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOO75962 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOO75962 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOO75962 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIOO75962 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOO75962 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOO75962 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOO75962 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOO75962 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOO75962 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOO75962 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOO75962 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOO75962 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIOO75962 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIOO75962 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms