Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GADD45BO75293 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GADD45BO75293 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GADD45BO75293 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms