Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRP4O75096 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRP4O75096 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRP4O75096 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP4O75096 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP4O75096 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP4O75096 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP4O75096 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP4O75096 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP4O75096 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP4O75096 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP4O75096 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP4O75096 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP4O75096 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP4O75096 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP4O75096 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP4O75096 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP4O75096 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP4O75096 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP4O75096 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP4O75096 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP4O75096 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP4O75096 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
LRP4O75096 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRP4O75096 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRP4O75096 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRP4O75096 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRP4O75096 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRP4O75096 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRP4O75096 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRP4O75096 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP4O75096 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP4O75096 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP4O75096 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP4O75096 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP4O75096 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP4O75096 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRP4O75096 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRP4O75096 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRP4O75096 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRP4O75096 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP4O75096 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP4O75096 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP4O75096 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP4O75096 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP4O75096 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP4O75096 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP4O75096 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP4O75096 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP4O75096 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP4O75096 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP4O75096 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP4O75096 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP4O75096 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP4O75096 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP4O75096 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP4O75096 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP4O75096 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP4O75096 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP4O75096 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP4O75096 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP4O75096 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRP4O75096 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRP4O75096 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP4O75096 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP4O75096 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP4O75096 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP4O75096 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP4O75096 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP4O75096 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP4O75096 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP4O75096 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP4O75096 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP4O75096 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP4O75096 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP4O75096 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP4O75096 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP4O75096 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP4O75096 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP4O75096 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP4O75096 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP4O75096 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRP4O75096 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRP4O75096 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRP4O75096 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRP4O75096 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRP4O75096 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRP4O75096 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRP4O75096 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRP4O75096 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRP4O75096 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRP4O75096 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRP4O75096 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP4O75096 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP4O75096 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP4O75096 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP4O75096 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP4O75096 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP4O75096 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP4O75096 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms