Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DTNBO60941 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DTNBO60941 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DTNBO60941 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
DTNBO60941 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
DTNBO60941 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DTNBO60941 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DTNBO60941 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DTNBO60941 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DTNBO60941 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DTNBO60941 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DTNBO60941 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DTNBO60941 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DTNBO60941 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DTNBO60941 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DTNBO60941 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DTNBO60941 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DTNBO60941 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DTNBO60941 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DTNBO60941 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DTNBO60941 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DTNBO60941 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DTNBO60941 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DTNBO60941 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DTNBO60941 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DTNBO60941 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DTNBO60941 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DTNBO60941 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DTNBO60941 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DTNBO60941 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DTNBO60941 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DTNBO60941 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DTNBO60941 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DTNBO60941 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DTNBO60941 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DTNBO60941 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DTNBO60941 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DTNBO60941 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DTNBO60941 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DTNBO60941 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DTNBO60941 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DTNBO60941 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DTNBO60941 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DTNBO60941 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DTNBO60941 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DTNBO60941 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DTNBO60941 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DTNBO60941 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DTNBO60941 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DTNBO60941 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DTNBO60941 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DTNBO60941 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DTNBO60941 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DTNBO60941 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DTNBO60941 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DTNBO60941 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DTNBO60941 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DTNBO60941 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DTNBO60941 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DTNBO60941 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DTNBO60941 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DTNBO60941 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTNBO60941 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DTNBO60941 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DTNBO60941 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DTNBO60941 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DTNBO60941 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DTNBO60941 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTNBO60941 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DTNBO60941 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms