Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNSO60931 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNSO60931 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNSO60931 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNSO60931 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNSO60931 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNSO60931 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNSO60931 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNSO60931 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNSO60931 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNSO60931 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNSO60931 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNSO60931 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNSO60931 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNSO60931 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNSO60931 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNSO60931 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNSO60931 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNSO60931 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNSO60931 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNSO60931 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNSO60931 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNSO60931 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNSO60931 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNSO60931 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNSO60931 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNSO60931 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNSO60931 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNSO60931 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNSO60931 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNSO60931 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNSO60931 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNSO60931 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNSO60931 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNSO60931 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNSO60931 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNSO60931 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNSO60931 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNSO60931 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNSO60931 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNSO60931 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNSO60931 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNSO60931 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNSO60931 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNSO60931 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNSO60931 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNSO60931 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNSO60931 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNSO60931 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNSO60931 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNSO60931 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNSO60931 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNSO60931 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNSO60931 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNSO60931 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNSO60931 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNSO60931 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNSO60931 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNSO60931 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNSO60931 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNSO60931 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNSO60931 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNSO60931 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNSO60931 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNSO60931 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNSO60931 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNSO60931 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNSO60931 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNSO60931 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNSO60931 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNSO60931 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNSO60931 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNSO60931 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNSO60931 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNSO60931 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNSO60931 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNSO60931 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNSO60931 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNSO60931 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNSO60931 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNSO60931 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNSO60931 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNSO60931 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNSO60931 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNSO60931 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNSO60931 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNSO60931 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNSO60931 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNSO60931 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNSO60931 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNSO60931 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNSO60931 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNSO60931 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNSO60931 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNSO60931 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNSO60931 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNSO60931 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNSO60931 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNSO60931 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNSO60931 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms