Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL4O60488 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL4O60488 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL4O60488 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL4O60488 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACSL4O60488 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms