Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCM3APO60318 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCM3APO60318 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms