Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAK2O60296 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAK2O60296 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1716.1 ms