Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL13O43927 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms