Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EXTL3O43909 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXTL3O43909 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXTL3O43909 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms