Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCO2O43819 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCO2O43819 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCO2O43819 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCO2O43819 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCO2O43819 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCO2O43819 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCO2O43819 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCO2O43819 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCO2O43819 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCO2O43819 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCO2O43819 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCO2O43819 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCO2O43819 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCO2O43819 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCO2O43819 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCO2O43819 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCO2O43819 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCO2O43819 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCO2O43819 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCO2O43819 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCO2O43819 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCO2O43819 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCO2O43819 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCO2O43819 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCO2O43819 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCO2O43819 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCO2O43819 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCO2O43819 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCO2O43819 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCO2O43819 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCO2O43819 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCO2O43819 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCO2O43819 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCO2O43819 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCO2O43819 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCO2O43819 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCO2O43819 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCO2O43819 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCO2O43819 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCO2O43819 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCO2O43819 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCO2O43819 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCO2O43819 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCO2O43819 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCO2O43819 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCO2O43819 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCO2O43819 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCO2O43819 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCO2O43819 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCO2O43819 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO2O43819 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO2O43819 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO2O43819 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO2O43819 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO2O43819 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO2O43819 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO2O43819 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO2O43819 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO2O43819 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO2O43819 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO2O43819 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCO2O43819 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCO2O43819 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCO2O43819 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCO2O43819 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCO2O43819 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCO2O43819 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCO2O43819 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCO2O43819 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCO2O43819 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCO2O43819 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCO2O43819 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCO2O43819 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCO2O43819 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCO2O43819 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO2O43819 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO2O43819 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO2O43819 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO2O43819 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO2O43819 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO2O43819 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO2O43819 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO2O43819 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO2O43819 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO2O43819 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO2O43819 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO2O43819 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO2O43819 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCO2O43819 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCO2O43819 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCO2O43819 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCO2O43819 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCO2O43819 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCO2O43819 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCO2O43819 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCO2O43819 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCO2O43819 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCO2O43819 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCO2O43819 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms