Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT86O43790 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT86O43790 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT86O43790 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT86O43790 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT86O43790 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT86O43790 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT86O43790 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT86O43790 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT86O43790 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT86O43790 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT86O43790 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT86O43790 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT86O43790 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT86O43790 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT86O43790 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT86O43790 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT86O43790 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT86O43790 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT86O43790 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT86O43790 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT86O43790 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT86O43790 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT86O43790 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT86O43790 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT86O43790 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT86O43790 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT86O43790 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT86O43790 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT86O43790 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT86O43790 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT86O43790 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT86O43790 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT86O43790 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT86O43790 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT86O43790 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT86O43790 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT86O43790 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT86O43790 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT86O43790 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT86O43790 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT86O43790 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT86O43790 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT86O43790 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT86O43790 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT86O43790 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT86O43790 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT86O43790 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT86O43790 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT86O43790 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT86O43790 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT86O43790 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT86O43790 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT86O43790 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT86O43790 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT86O43790 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT86O43790 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT86O43790 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT86O43790 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT86O43790 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT86O43790 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT86O43790 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT86O43790 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT86O43790 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT86O43790 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT86O43790 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT86O43790 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT86O43790 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT86O43790 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT86O43790 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT86O43790 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT86O43790 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT86O43790 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT86O43790 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT86O43790 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT86O43790 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT86O43790 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT86O43790 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT86O43790 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT86O43790 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT86O43790 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT86O43790 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT86O43790 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT86O43790 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT86O43790 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT86O43790 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT86O43790 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT86O43790 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT86O43790 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT86O43790 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT86O43790 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT86O43790 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT86O43790 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT86O43790 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT86O43790 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT86O43790 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT86O43790 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT86O43790 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT86O43790 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT86O43790 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms