Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITM2AO43736 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITM2AO43736 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms