Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC01565O15544 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LINC01565O15544 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LINC01565O15544 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms