Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms