Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAPBPO15533 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms