Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PFDN6O15212 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PFDN6O15212 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms