Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms