Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IKBKBO14920 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IKBKBO14920 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
IKBKBO14920 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 328.3 ms