Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFIT3O14879 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFIT3O14879 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms