Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCKDKO14874 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1668.9 ms