Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCSO14618 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCSO14618 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCSO14618 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCSO14618 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCSO14618 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCSO14618 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCSO14618 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCSO14618 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCSO14618 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCSO14618 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCSO14618 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCSO14618 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCSO14618 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCSO14618 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCSO14618 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCSO14618 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCSO14618 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCSO14618 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCSO14618 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCSO14618 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCSO14618 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCSO14618 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCSO14618 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCSO14618 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCSO14618 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCSO14618 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCSO14618 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCSO14618 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCSO14618 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCSO14618 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCSO14618 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCSO14618 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCSO14618 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCSO14618 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCSO14618 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSO14618 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSO14618 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSO14618 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSO14618 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSO14618 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSO14618 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSO14618 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSO14618 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSO14618 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSO14618 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSO14618 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSO14618 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSO14618 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSO14618 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSO14618 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSO14618 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSO14618 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSO14618 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSO14618 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSO14618 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSO14618 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSO14618 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSO14618 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSO14618 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSO14618 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSO14618 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSO14618 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSO14618 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSO14618 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSO14618 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSO14618 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSO14618 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSO14618 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSO14618 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSO14618 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSO14618 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSO14618 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSO14618 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSO14618 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSO14618 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSO14618 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSO14618 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSO14618 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCSO14618 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCSO14618 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSO14618 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSO14618 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSO14618 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSO14618 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSO14618 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSO14618 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSO14618 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSO14618 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSO14618 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSO14618 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSO14618 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSO14618 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSO14618 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSO14618 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSO14618 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSO14618 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSO14618 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSO14618 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSO14618 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms