Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN4O14493 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN4O14493 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms