Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGPSO00116 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGPSO00116 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGPSO00116 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGPSO00116 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGPSO00116 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AGPSO00116 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPSO00116 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPSO00116 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPSO00116 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPSO00116 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPSO00116 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPSO00116 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPSO00116 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGPSO00116 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
AGPSO00116 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGPSO00116 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGPSO00116 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPSO00116 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPSO00116 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPSO00116 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPSO00116 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPSO00116 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPSO00116 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPSO00116 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPSO00116 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPSO00116 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPSO00116 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPSO00116 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPSO00116 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPSO00116 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPSO00116 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPSO00116 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPSO00116 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPSO00116 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPSO00116 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPSO00116 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPSO00116 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPSO00116 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPSO00116 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPSO00116 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPSO00116 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGPSO00116 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGPSO00116 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGPSO00116 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGPSO00116 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGPSO00116 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGPSO00116 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPSO00116 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPSO00116 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPSO00116 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPSO00116 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPSO00116 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPSO00116 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPSO00116 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPSO00116 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPSO00116 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPSO00116 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPSO00116 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGPSO00116 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGPSO00116 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGPSO00116 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGPSO00116 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGPSO00116 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGPSO00116 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGPSO00116 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AGPSO00116 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPSO00116 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPSO00116 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPSO00116 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGPSO00116 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AGPSO00116 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGPSO00116 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AGPSO00116 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AGPSO00116 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGPSO00116 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGPSO00116 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGPSO00116 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGPSO00116 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGPSO00116 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPSO00116 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPSO00116 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPSO00116 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPSO00116 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPSO00116 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPSO00116 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPSO00116 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPSO00116 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGPSO00116 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGPSO00116 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGPSO00116 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AGPSO00116 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGPSO00116 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGPSO00116 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGPSO00116 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGPSO00116 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGPSO00116 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPSO00116 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPSO00116 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPSO00116 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms