Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QRK9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QRK9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QRK9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QRK9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QRK9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QRK9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QRK9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QRK9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QRK9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QRK9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRK9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRK9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRK9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRK9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRK9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRK9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRK9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRK9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRK9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRK9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRK9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
J3QRK9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QRK9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QRK9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QRK9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QRK9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QRK9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QRK9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QRK9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QRK9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QRK9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRK9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRK9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRK9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRK9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRK9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRK9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRK9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRK9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRK9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRK9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRK9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRK9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRK9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRK9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRK9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRK9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRK9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRK9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRK9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRK9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRK9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRK9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRK9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRK9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRK9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRK9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRK9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRK9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRK9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRK9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRK9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRK9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
J3QRK9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
J3QRK9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
J3QRK9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRK9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRK9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRK9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRK9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRK9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QRK9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QRK9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QRK9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QRK9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QRK9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QRK9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QRK9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QRK9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QRK9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QRK9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QRK9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QRK9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QRK9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QRK9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QRK9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QRK9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QRK9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QRK9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QRK9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QRK9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QRK9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QRK9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QRK9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
J3QRK9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
J3QRK9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QRK9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QRK9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QRK9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms