Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QRE1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QRE1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QRE1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QRE1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QRE1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QRE1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QRE1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QRE1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QRE1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QRE1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QRE1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QRE1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QRE1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QRE1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
J3QRE1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
J3QRE1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QRE1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QRE1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QRE1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRE1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRE1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRE1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRE1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRE1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRE1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRE1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRE1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRE1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRE1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRE1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRE1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRE1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRE1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRE1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRE1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QRE1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QRE1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QRE1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QRE1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRE1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRE1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRE1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRE1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRE1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRE1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRE1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRE1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRE1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRE1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
J3QRE1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRE1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRE1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRE1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRE1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRE1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRE1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRE1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRE1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRE1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRE1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRE1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRE1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRE1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRE1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRE1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRE1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRE1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRE1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRE1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRE1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRE1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRE1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRE1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRE1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRE1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRE1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRE1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRE1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRE1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRE1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRE1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRE1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QRE1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QRE1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QRE1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QRE1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QRE1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QRE1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QRE1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRE1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRE1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRE1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRE1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRE1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRE1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRE1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRE1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRE1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRE1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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