Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QQQ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QQQ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QQQ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QQQ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QQQ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QQQ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QQQ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QQQ9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QQQ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QQQ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
J3QQQ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QQQ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QQQ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QQQ9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QQQ9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QQQ9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QQQ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QQQ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QQQ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QQQ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QQQ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QQQ9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QQQ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QQQ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QQQ9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QQQ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QQQ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QQQ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QQQ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QQQ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QQQ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QQQ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QQQ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QQQ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QQQ9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QQQ9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QQQ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QQQ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QQQ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QQQ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QQQ9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QQQ9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QQQ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QQQ9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QQQ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QQQ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QQQ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QQQ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QQQ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QQQ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QQQ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QQQ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QQQ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QQQ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QQQ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QQQ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QQQ9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QQQ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QQQ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QQQ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
J3QQQ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
J3QQQ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QQQ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QQQ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QQQ9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QQQ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QQQ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QQQ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QQQ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QQQ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QQQ9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QQQ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QQQ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QQQ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QQQ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QQQ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QQQ9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QQQ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QQQ9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QQQ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QQQ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QQQ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QQQ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QQQ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3QQQ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3QQQ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
J3QQQ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3QQQ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QQQ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QQQ9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QQQ9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QQQ9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QQQ9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QQQ9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QQQ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3QQQ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3QQQ9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3QQQ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3QQQ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms