Protein–RNA interactions for Protein: I3L0E3

hCG_1984214, HCG1984214, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
hCG_1984214I3L0E3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
hCG_1984214I3L0E3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
hCG_1984214I3L0E3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
hCG_1984214I3L0E3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms