Protein–RNA interactions for Protein: H3BV60

TGFBR3L, Transforming growth factor-beta receptor type 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3LH3BV60 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGFBR3LH3BV60 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFBR3LH3BV60 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms