Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms