Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB9F8W1W9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms