Protein–RNA interactions for Protein: C9JN71

ZNF878, Zinc finger protein 878, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF878C9JN71 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF878C9JN71 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF878C9JN71 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF878C9JN71 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms