Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PATL2C9JE40 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PATL2C9JE40 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PATL2C9JE40 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms