Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH8

HNRNPCL2, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL2B2RXH8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HNRNPCL2B2RXH8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HNRNPCL2B2RXH8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HNRNPCL2B2RXH8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HNRNPCL2B2RXH8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HNRNPCL2B2RXH8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HNRNPCL2B2RXH8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HNRNPCL2B2RXH8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HNRNPCL2B2RXH8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms