Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HACD1B0YJ81 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACD1B0YJ81 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms