Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BECN2A8MW95 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN2A8MW95 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BECN2A8MW95 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms