Protein–RNA interactions for Protein: A6NLI5

TRIM64C, Putative tripartite motif-containing protein 64C, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64CA6NLI5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM64CA6NLI5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM64CA6NLI5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms